柳杉CAPS 遗传标记反应体系的优化 - 浙江农林大学

留言板

尊敬的读者、作者、审稿人, 关于本刊的投稿、审稿、编辑和出版的任何问题, 您可以本页添加留言。我们将尽快给您答复。谢谢您的支持!

姓名
邮箱
手机号码
标题
留言内容
验证码

柳杉CAPS 遗传标记反应体系的优化

杨萍,郑前剑,赵明水,汤定钦

文章导航> 浙江农林大学学报> 2006> 23(1): 52-55

杨萍, 郑前剑, 赵明水, 等. 柳杉CAPS 遗传标记反应体系的优化[J]. 浙江农林大学学报, 2006, 23(1): 52-55.

引用本文:

杨萍, 郑前剑, 赵明水, 等. 柳杉CAPS 遗传标记反应体系的优化[J]. 浙江农林大学学报, 2006, 23(1): 52-55.

YANG Ping, ZHENG Qian-jian, ZHAO Ming-shui, et al. Optimization of the reaction system for CAPS marker analysis in Cryptomeria fortunei[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2006, 23(1): 52-55.

Citation:

YANG Ping, ZHENG Qian-jian, ZHAO Ming-shui,et al. Optimization of the reaction system for CAPS marker analysis inCryptomeria fortunei[J].Journal of Zhejiang A&F University, 2006, 23(1): 52-55.

柳杉CAPS 遗传标记反应体系的优化

1.
浙江林学院浙江省现代森林培育技术重点实验室, 浙江临安 311300;
2.
浙江省天目山国家级自然保护区管理局, 浙江临安 311300

详细信息

作者简介:杨萍, 硕士, 从事林木生物技术研究。E-mail: yangping@zjfc.edu.cn

通信作者:汤定钦, 教授, 博士, 从事林木生物技术研究。

中图分类号:S718.43; Q523

Optimization of the reaction system for CAPS marker analysis inCryptomeria fortunei

1.
Key Labratory for Modern Silvicultural Technology of Zhejiang Province , Zhejiang Forestry College , Lin’an 311300, Zhejiang , China;
2.
.Management Office , National Nature Reserve of Mount Tianmu , Lin’an 311300 , Zhejiang , China

摘要:建立柳杉Cryptomeria fortunei CAPS 反应优化体系是进行柳杉遗传多样性研究的前提。通过对影响柳杉CAPS 遗传标记反应体系结果主要因子的研究, 确定了最佳的柳杉CAPS 扩增反应体系:含有2.0 L 10 Buffer , 0.08 mmolL-1dNTPs , 200mgL-1铸型DNA , 1.5 mmolL-1MgCl2 , 0.1 molL-1引物和41.675 nkat Taq DNA 聚合酶的20 L 反应液。扩增程序是94℃预变性5min , 然后94 ℃变性40 s , 58 ℃退火40 s , 72 ℃延伸80 s , 共35 个循环, 然后在72 ℃延伸5 min 。PCR 产物10.0 L, 加入2.0 L 10 Buffer , 83.350 nkat 内切酶, 7.5 L 双蒸水构成20 L 酶切反应体系。图5 表1 参8
- 植物学/
- 柳杉/
- 切割的扩增产物多态性序列(CAPS)/
- DNA 标记/
- 反应体系/
- 优化
Abstract:An optimized system for CAPS reaction in Cryptomeria fortunei is a precondition for analyzing genetic diversity of Cryptomeria fortunei .The authors optimized a reaction system for CAPS in Cryptomeria fortunei by analyzing different factors .The results showed that the best one was 20 L amplification reaction solution composed of 2.0 L 10 Buffer , 0.08 mmolL-1dNTPs , 200 mgL-1 template DNA , 1.5 mmolL-1 Mg2+ , 0.1 mol L-1primer and 41.675 nkat Taq DNA polymerase , which was amplified under the program of predenaturing at 94 ℃ for 5min , followed by 35 cycles of denaturing at 94 ℃for 40 s , annealing 58 ℃for 40 s , extension 72 ℃for 80 s , and a final extension 72 ℃ for 5 min .The restriction digestion system consisted of 10 L PCR products , 2.0 L 10 Buffer , 83.350 nkat restriction enzyme and 7.5 L ddH2O .[ Ch , 5 fig .1 tab .8 ref .]
- botany/
- Cryptomeria fortunei/
- CAPS/
- DNA marker/
- reaction system/
- optimization

[1]	王晨, 张俊红, 张苗, 许雯婷, 楼雄珍, 童再康.柳杉优良无性系组培快繁体系研究. 浙江农林大学学报, 2020, 37(4): 810-816.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.20190484
[2]	何自强, 张惠玲, 杨正雄.响应面优化超声波辅助[Bmim]Cl-K₂HPO₄双水相提取黄秋葵多糖. 浙江农林大学学报, 2020, 37(3): 547-555.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.20190339
[3]	王丹, 马元丹, 郭慧媛, 高岩, 张汝民, 侯平.模拟酸雨胁迫与柳杉凋落物对土壤养分及微生物的影响. 浙江农林大学学报, 2015, 32(2): 195-203.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2015.02.005
[4]	蒋玉俭, 李新鑫, 孙飞飞, 余学军.竹林土壤中纤维素降解菌的筛选及产酶条件优化. 浙江农林大学学报, 2015, 32(6): 821-828.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2015.06.001
[5]	邹翠翠, 俞飞, 沈卫东, 张珊珊, 王俊龙, 张汝民, 侯平.酸雨与凋落物复合作用对柳杉种子萌发与幼苗生长的影响. 浙江农林大学学报, 2014, 31(1): 1-8.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2014.01.001
[6]	田风光, 何颖飞, 段承俐.七叶一枝花ISSR-PCR反应体系的建立. 浙江农林大学学报, 2014, 31(6): 983-989.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2014.06.023
[7]	彭珠清, 范辉华, 刘宝, 刘燕, 李静.无患子SRAP-PCR反应体系的优化. 浙江农林大学学报, 2014, 31(2): 322-328.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2014.02.024
[8]	黄一名, 杨淑贞, 赵明水, 陈嘉琦, 吴建其, 温国胜.物理去瘤法对天目山柳杉瘿瘤病的影响. 浙江农林大学学报, 2013, 30(6): 910-913.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2013.06.016
[9]	武冲, 仲崇禄, 张勇, 姜清彬, 陈羽, 陈珍.麻楝ISSR-PCR反应体系的建立及优化. 浙江农林大学学报, 2013, 30(4): 620-626.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2013.04.024
[10]	蒋文伟, 郭运雪, 杨淑贞, 赵明水.天目山柳杉古树的树干液流速率时空变化. 浙江农林大学学报, 2012, 29(6): 859-866.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2012.06.009
[11]	林二培, 马海泉, 樊民亮, 骆文坚, 黄华宏, 童再康.百山祖冷杉SSR体系的建立及人工辅助授粉子代的初步鉴定. 浙江农林大学学报, 2011, 28(2): 234-240.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2011.02.010
[12]	李国会, 温国胜, 田海涛, 张利阳, 李佳, 黄浩.天目山不同海拔高度柳杉瘿瘤病对柳杉健康的影响. 浙江农林大学学报, 2010, 27(4): 483-488.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2010.04.001
[13]	杨淑贞, 李国会, 杜晴洲, 温国胜.输营养液对天目山柳杉的影响. 浙江农林大学学报, 2009, 26(6): 810-814.
[14]	赵丽娟, 蒋文伟, 杨淑贞, 赵明水, 温国胜.天目山柳杉的茎干液流特征. 浙江农林大学学报, 2009, 26(2): 169-175.
[15]	曹福亮, 王国霞, 李广平, 花喆斌.银杏ISSR-PCR扩增反应体系的优化. 浙江农林大学学报, 2008, 25(2): 186-190.
[16]	夏爱梅, 达良俊, 朱虹霞, 赵明水.天目山柳杉群落结构及其更新类型. 浙江农林大学学报, 2004, 21(1): 44-50.
[17]	王正加, 黄坚钦, 郭传友, 杨萍, 王华芳.山核桃RAPD 反应体系的优化. 浙江农林大学学报, 2003, 20(4): 429-433.
[18]	王胜奎.森林可持续发展的动态优化模型. 浙江农林大学学报, 2001, 18(3): 233-237.
[19]	林平, 叶正环, 朱昌乐, 侯建育.柳杉连栽林地的土壤肥力特性. 浙江农林大学学报, 1994, 11(2): 138-142.
[20]	张卓文, 朱昌乐, 潘建瑞, 刘建南, 叶正环.柳杉花粉的散发规律. 浙江农林大学学报, 1994, 11(1): 21-25.

链接本文:
https://zlxb.zafu.edu.cn/article/id/1437
https://zlxb.zafu.edu.cn/article/zjnldxxb/2006/1/52

WeChat

点击查看大图

计量

文章访问数:2211
HTML全文浏览量:324
PDF下载量:266
被引次数:0

柳杉CAPS 遗传标记反应体系的优化

1. 浙江林学院浙江省现代森林培育技术重点实验室, 浙江临安 311300;
2. 浙江省天目山国家级自然保护区管理局, 浙江临安 311300

作者简介:
杨萍, 硕士, 从事林木生物技术研究。E-mail: yangping@zjfc.edu.cn

通信作者:汤定钦, 教授, 博士, 从事林木生物技术研究。

收稿日期: 2004-11-16
修回日期:2005-09-29
刊出日期: 2006-02-20

中图分类号:S718.43; Q523

关键词:

摘要:建立柳杉Cryptomeria fortunei CAPS 反应优化体系是进行柳杉遗传多样性研究的前提。通过对影响柳杉CAPS 遗传标记反应体系结果主要因子的研究, 确定了最佳的柳杉CAPS 扩增反应体系:含有2.0 L 10 Buffer , 0.08 mmolL-1dNTPs , 200mgL-1铸型DNA , 1.5 mmolL-1MgCl2 , 0.1 molL-1引物和41.675 nkat Taq DNA 聚合酶的20 L 反应液。扩增程序是94℃预变性5min , 然后94 ℃变性40 s , 58 ℃退火40 s , 72 ℃延伸80 s , 共35 个循环, 然后在72 ℃延伸5 min 。PCR 产物10.0 L, 加入2.0 L 10 Buffer , 83.350 nkat 内切酶, 7.5 L 双蒸水构成20 L 酶切反应体系。图5 表1 参8

English Abstract

杨萍, 郑前剑, 赵明水, 等. 柳杉CAPS 遗传标记反应体系的优化[J]. 浙江农林大学学报, 2006, 23(1): 52-55.

引用本文:

杨萍, 郑前剑, 赵明水, 等. 柳杉CAPS 遗传标记反应体系的优化[J]. 浙江农林大学学报, 2006, 23(1): 52-55.

YANG Ping, ZHENG Qian-jian, ZHAO Ming-shui, et al. Optimization of the reaction system for CAPS marker analysis in Cryptomeria fortunei[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2006, 23(1): 52-55.

Citation:

YANG Ping, ZHENG Qian-jian, ZHAO Ming-shui,et al. Optimization of the reaction system for CAPS marker analysis inCryptomeria fortunei[J].Journal of Zhejiang A&F University, 2006, 23(1): 52-55.

全文HTML

/

下载: 全尺寸图片幻灯片

分享

用微信扫码二维码

分享至好友和朋友圈

返回