新高系梨9个品种SSR 标记分析 - 浙江农林大学

留言板

尊敬的读者、作者、审稿人, 关于本刊的投稿、审稿、编辑和出版的任何问题, 您可以本页添加留言。我们将尽快给您答复。谢谢您的支持!

姓名
邮箱
手机号码
标题
留言内容
验证码

新高系梨9个品种SSR 标记分析

莫文娟,袁德义,段经华,邹锋

文章导航> 浙江农林大学学报> 2009> 26(5): 639-643

莫文娟, 袁德义, 段经华, 等. 新高系梨9个品种SSR 标记分析[J]. 浙江农林大学学报, 2009, 26(5): 639-643.

引用本文:

莫文娟, 袁德义, 段经华, 等. 新高系梨9个品种SSR 标记分析[J]. 浙江农林大学学报, 2009, 26(5): 639-643.

MO Wen-juan, YUAN De-yi, DUAN Jing-hua, et al. Simple sequence repeat analysis on pear cultivars in Niitaka line[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2009, 26(5): 639-643.

Citation:

MO Wen-juan, YUAN De-yi, DUAN Jing-hua,et al. Simple sequence repeat analysis on pear cultivars in Niitaka line[J].Journal of Zhejiang A&F University, 2009, 26(5): 639-643.

新高系梨9个品种SSR 标记分析

1.
中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室，湖南长沙 410004;
2.
中国林业科学研究院经济林研究开发中心，河南郑州 450003

详细信息

通信作者:袁德义

Simple sequence repeat analysis on pear cultivars in Niitaka line

1.
The Key Laboratory of Non-wood Forestry Product of State Forestry Administration，Central South Forestry & Technology University，Changsha 410004，Hunan，China;
2.
Non-timber Research and Development Center，The Chinese Academy of Forestry，Zhengzhou 450003，Henan，China

More Information

Corresponding author:YUAN De-yi

摘要:为了有效区分和利用亲缘关系较近的新高系梨品种，利用简单序列重复（SSR）分子标记技术对新高系梨9个品种进行了多态性分析、遗传相似性和聚类分析。从12对引物中筛选出3对多态性高、分辨能力强的引物，在供试材料中共扩增出22条带，其中多态性带22条，多态性达100%；每对引物扩增出的条带数4 ～ 9条不等，平均为7.3条；且这3对引物组合可以成功地区分全部供试品种。9份材料之间遗传相似系数变化范围为0.47 ～ 0.91，平均值为0.67，揭示出它们的遗传基础相对比较狭窄。加权成组配对法（UPGMA）聚类分析结果表明，供试材料可以分为3个组和2个亚组，其中新高Pyrus pyrifolia ‘Niitaka’和黄金‘Whangkeum Bae’，大果水晶‘Sujeong’和华丰‘Huafeng’的相似系数最大，为0.91，说明其亲缘关系最近；天皇‘Yewang’和鲜黄‘Sunhwang’分别单独聚为一类，并对其结果的原因进行了初步探讨。图3表3参17
- 园艺学/
- 新高系梨/
- 简单重复序列（SSR）/
- 亲缘关系/
- 聚类分析
Abstract:In order to efficiently distinguish and use pear cultivars come of Pyrus pyrifolia ‘Niitaka’with a near genetic relationship，the polymorphism and cluster analysis based on genetic similarity matrices of simple sequence repeat（SSR） markers were used on nine cultivars. Results showed that 3 pairs of SSR primes（KA4b，NH013a and CH02D11） produced 22 amplified fragments of which 22（100%） were polymorphic. The average number of alleles per SSR locus was 7.3 with a range from 4 to 9. Using these 3 sets of SSR primers could discriminate 9 cultivars in the study. Also，the genetic similarity coefficients among the 9 cultivars ranged from 0.47 to 0.91 with an average of 0.67，which indicated that the genetic relationships were close between them. The UPGMA cluster analysis showed that the 9 cultivars could be divided into 3 groups and 2 sub-groups. The closest relationship was ‘Niitaka’，‘Whangkeum Bae’，‘Sujeong’，and ‘Huafeng’，whose genetic similarity coefficient is 0.91，while ‘Yewang’ and ‘Sunhwang’ were highly divergent from the other cultivars. ［Ch，3 fig. 3 tab. 17 ref.］
- horticulture/
- pear cultivars in Niitaka line/
- simple sequence repeat（SSR）/
- genetic relationship/
- cluster analysis

[1]	火艳, 招雪晴, 黄厚毅, 黄贤斌, 许云方, 祝遵凌, 苑兆和.观赏石榴表型遗传多样性分析. 浙江农林大学学报, 2020, 37(5): 939-949.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.20190619
[2]	洪森荣, 曾清华, 谭鑫, 陈永华, 郑亚娇, 徐迎昕, 邱梦琴.上饶早梨‘六月雪’和‘黄皮消’全基因组重测序分析. 浙江农林大学学报, 2019, 36(2): 227-235.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2019.02.003
[3]	尹跃, 安巍, 赵建华, 王亚军, 樊云芳, 曹有龙.黑果枸杞转录组SSR信息分析及分子标记开发. 浙江农林大学学报, 2019, 36(2): 422-428.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2019.02.025
[4]	王伟丽, 何立平, 余敏芬, 袁虎威, 闫道良, 赵亮, 余有祥, 刘军, 赵鹂, 郑炳松.12个北美冬青品种的ISSR亲缘关系分析. 浙江农林大学学报, 2018, 35(4): 612-617.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2018.04.005
[5]	朱咪咪, 张迟, 常爱玲, 党婉誉, 周彩红, 俞狄虎, 吴莹莹, 张敏.‘无籽’瓯柑小孢子母细胞减数分裂特性基因RAD51和MS1的表达差异分析. 浙江农林大学学报, 2016, 33(6): 921-927.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2016.06.001
[6]	张梅, 刘利, 伊力塔.辽宁白石砬子国家级自然保护区植物区系的多样性. 浙江农林大学学报, 2014, 31(2): 210-216.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2014.02.008
[7]	刘宝, 范辉华, 彭珠清, 刘燕, 陈存及.不同地理种源无患子的分子多态性分析. 浙江农林大学学报, 2014, 31(1): 151-155.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2014.01.023
[8]	吴月燕, 陶巧静, 李波, 许丹叶.西洋杜鹃SRAP体系优化及遗传多样性分析. 浙江农林大学学报, 2013, 30(6): 844-851.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2013.06.007
[9]	王国立, 安华明, 秦巧平, 李孟娇, 刘真真, 陈佳莹, 周倩, 张岚岚.柑橘果实成熟特异基因CsPMEI/InvI的克隆与序列分析. 浙江农林大学学报, 2013, 30(3): 336-342.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2013.03.005
[10]	闫双喜, 闫丽君, 张志翔.河南薄山种子植物区系特征及其与邻近地区的关系. 浙江农林大学学报, 2011, 28(3): 391-399.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2011.03.008
[11]	沈俊岭, 倪慧群, 陈晓阳, 黄少伟.麻疯树遗传多样性的相关序列扩增多态性（SRAP）分析. 浙江农林大学学报, 2010, 27(3): 347-353.doi:10.11833/j.issn.2095-0756.2010.03.005
[12]	郑勇平, 郑泉, 俞继英, 张瑛, 范文锋.春石斛杂交育种及亲缘关系的AFLP分析. 浙江农林大学学报, 2009, 26(1): 137-141.
[13]	张俊红, 卢洋海, 卢泳全, 章健平, 斯金平.红晶李与其他李品种之间亲缘关系的研究. 浙江农林大学学报, 2009, 26(1): 58-62.
[14]	高焕晔, 熊源新, 苟光前.贵州红水河沟谷残存季雨林蕨类植物区系初步研究. 浙江农林大学学报, 2008, 25(1): 48-54.
[15]	吴祝华, 施季森, 席梦利, 刘光欣.百合种质资源花粉形态及亲缘关系研究. 浙江农林大学学报, 2007, 24(4): 406-412.
[16]	曾燕如, 胡瑛, 斯金平, 徐象华.浙江丽水16 个柑橘特色品种的RAPD 分析. 浙江农林大学学报, 2005, 22(5): 481-485.
[17]	梁健, 孙婷.延安林区啮齿动物群落的聚类分析. 浙江农林大学学报, 2004, 21(1): 70-74.
[18]	景芸, 梁一池, 杨华.不同锥栗无性系果实营养成分的比较分析. 浙江农林大学学报, 2004, 21(2): 176-179.
[19]	程晓建, 杨萍, 林伯年, 郑炳松.应用RAPD 技术探讨红叶李、李和杏的亲缘关系. 浙江农林大学学报, 2004, 21(1): 40-43.
[20]	刘安兴.树高曲线聚类分析研究. 浙江农林大学学报, 2001, 18(3): 228-232.

链接本文:
https://zlxb.zafu.edu.cn/article/id/490
https://zlxb.zafu.edu.cn/article/zjnldxxb/2009/5/639

WeChat

点击查看大图

计量

文章访问数:4606
HTML全文浏览量:293
PDF下载量:150
被引次数:0

新高系梨9个品种SSR 标记分析

1. 中南林业科技大学经济林育种与栽培国家林业局重点实验室，湖南长沙 410004;
2. 中国林业科学研究院经济林研究开发中心，河南郑州 450003

通信作者:袁德义

刊出日期: 2009-10-20

关键词:

摘要:为了有效区分和利用亲缘关系较近的新高系梨品种，利用简单序列重复（SSR）分子标记技术对新高系梨9个品种进行了多态性分析、遗传相似性和聚类分析。从12对引物中筛选出3对多态性高、分辨能力强的引物，在供试材料中共扩增出22条带，其中多态性带22条，多态性达100%；每对引物扩增出的条带数4 ～ 9条不等，平均为7.3条；且这3对引物组合可以成功地区分全部供试品种。9份材料之间遗传相似系数变化范围为0.47 ～ 0.91，平均值为0.67，揭示出它们的遗传基础相对比较狭窄。加权成组配对法（UPGMA）聚类分析结果表明，供试材料可以分为3个组和2个亚组，其中新高Pyrus pyrifolia ‘Niitaka’和黄金‘Whangkeum Bae’，大果水晶‘Sujeong’和华丰‘Huafeng’的相似系数最大，为0.91，说明其亲缘关系最近；天皇‘Yewang’和鲜黄‘Sunhwang’分别单独聚为一类，并对其结果的原因进行了初步探讨。图3表3参17

English Abstract

莫文娟, 袁德义, 段经华, 等. 新高系梨9个品种SSR 标记分析[J]. 浙江农林大学学报, 2009, 26(5): 639-643.

引用本文:

莫文娟, 袁德义, 段经华, 等. 新高系梨9个品种SSR 标记分析[J]. 浙江农林大学学报, 2009, 26(5): 639-643.

MO Wen-juan, YUAN De-yi, DUAN Jing-hua, et al. Simple sequence repeat analysis on pear cultivars in Niitaka line[J]. Journal of Zhejiang A&F University, 2009, 26(5): 639-643.

Citation:

MO Wen-juan, YUAN De-yi, DUAN Jing-hua,et al. Simple sequence repeat analysis on pear cultivars in Niitaka line[J].Journal of Zhejiang A&F University, 2009, 26(5): 639-643.

全文HTML

/

下载: 全尺寸图片幻灯片

分享

用微信扫码二维码

分享至好友和朋友圈

返回